王志军 2007年03月05日 13:46
 |
| PAMGO科学家研究中的植物微生物,微生物附着在农作物、灌木细胞上。 |
一个国际科学家小组最近对致病和有益微生物以及它们宿主基因的通用语言进行了扩展。这种叫做基因本体(GO)的“混合语”可使研究人员用一组通用的语言来描述微生物与它们的宿主间的交流。
欧洲生物信息研究所的植物微生物基因本体(PAMGO)协会和GO协会的全体人员核准并发布了450多项新的描述微生物和宿主交流基因产物的术语。美国国家科学基金会(NSF)和美国农业部州际合作研究教育与推广局(CSREES)通过允许他们加入微生物基因序列项目来支持这项PAMGO计划。
这一新的“通用术语”将加速预防致病微生物感染而保留和促进有益微生物存在技术的发展。科学家们说,基因本体论将为我们提供一个比较各种致病微生物基因和蛋白功能的强有力工具。美国国家科学基金会分子和细胞生物学主任玛丽安娜.赫恩卡说,有关微生物和宿主间信息交流的这样一组通用术语将有助于研究人员沟通信息,并扩展微生物和宿主研究中的一些概念。
与植物和动物有关的微生物可以是致病的,也可以是中立或有益的,但它们在与它们的宿主进行相互作用时有许多共同之处。例如,所有这些微生物必须首先附着到宿主上。PAMGO从一开始就制作出了这些术语,所以在描述植物或动物中的有益和致病微生物的时候是有帮助的。弗吉尼亚生物技术研究所PAMGO计划主任布雷特.泰勒说,接触这些生物体并有这样一组描述致病和有益微生物基因的术语,对了解宿主与微生物的交流是至关重要的。
许多早期的描述生物体功能和程序的GO术语都是基于微生物的,很少用来描述微生物在它们宿主中的情况。PAMGO起初创建了描述为生物与植物间作用的术语,但研究人员不久后发现,几乎所有的这些术语也适合用于微生物和动物以及人的相互作用。